Информационное издание о фармацевтическом рынке Москва · Среда, 2026
Фармацевтический вестник

Аналитика · Регулирование · Рынок

Главная / Налогообложение аптеки: выбор системы налогов

Фармацевтика и аптечный бизнес

Налогообложение аптеки: выбор системы налогов

Правильный выбор системы налогообложения — один из ключевых факторов, определяющих финансовую эффективность аптечного бизнеса. Ошибка на старте может обернуться избыточной налоговой нагрузкой, штрафами и дополнительными расходами на бухгалтерию. Каждая аптека — будь то одиночная точка или сеть — обязана разобраться в доступных режимах и выбрать оптимальный ещё до начала работы.

На сегодняшний день аптека может применять несколько систем налогообложения: общую (ОСНО), упрощённую (УСН), а при определённых условиях — патентную (ПСН). Каждый режим имеет свои преимущества, ограничения и особенности расчёта налоговой базы. Ниже — подробный разбор каждого варианта.

Важно

Материал носит информационный характер. Перед принятием решения о выборе системы налогообложения рекомендуем проконсультироваться с лицензированным налоговым консультантом или бухгалтером.

Обзор режимов

Какие системы налогообложения доступны аптеке

Бухгалтер аптеки сравнивает налоговые режимы за рабочим столом с документами и калькулятором

Режим 1

ОСНО

Общая система налогообложения. Обязательна для крупных аптечных сетей с оборотом свыше установленных лимитов. Подходит для работы с юридическими лицами, требующими счетов-фактур с НДС.

Режим 2

УСН

Упрощённая система налогообложения. Наиболее популярный режим для малых и средних аптек. Два варианта: «Доходы» (6%) и «Доходы минус расходы» (15%). Существенно снижает налоговую нагрузку.

Режим 3

ПСН

Патентная система налогообложения. Доступна только для ИП. Подходит для небольших аптек с численностью сотрудников до 15 человек и годовым доходом до 60 млн рублей.

«С 2021 года ЕНВД отменён, и аптеки, ранее применявшие его, перешли на другие режимы — преимущественно УСН или ОСНО. Важно учитывать это при анализе устаревших материалов по теме.»

Сравнительный анализ

Таблица сравнения систем налогообложения для аптеки

Параметр ОСНО УСН «Доходы» УСН «Д − Р» ПСН
Ставка налога 20% (налог на прибыль) + НДС 20% 6% от дохода 15% от разницы 6% от потенц. дохода
Лимит дохода Нет ограничений До 265,8 млн ₽ До 265,8 млн ₽ До 60 млн ₽
Форма бизнеса ИП, ООО ИП, ООО ИП, ООО Только ИП
НДС Да (с возможностью вычета) Нет Нет Нет
Сложность учёта Высокая Низкая Средняя Минимальная
Кол-во сотрудников Без ограничений До 130 чел. До 130 чел. До 15 чел.

* Лимиты доходов для УСН актуальны на 2024 год с учётом коэффициента-дефлятора. Уточняйте актуальные значения в ФНС.

Детальный разбор

Особенности каждого режима для аптечного бизнеса

01 ОСНО — для крупных аптечных сетей

Общая система налогообложения применяется аптеками по умолчанию, если они не перешли на специальный режим. ОСНО обязывает платить налог на прибыль (20%), НДС (10% или 20% в зависимости от категории товара), налог на имущество и НДФЛ за сотрудников.

Важный нюанс: большинство лекарственных препаратов облагается НДС по льготной ставке 10%, что снижает налоговую нагрузку. Однако аптеки, продающие косметику, БАДы и парафармацевтику, уплачивают стандартные 20%.

  • Подходит для аптек, работающих с больницами и поликлиниками (нужны счета-фактуры)
  • Обязательна при превышении лимитов по доходам для УСН
  • Требует штатного бухгалтера или аутсорсинга
  • Возможность возмещения входящего НДС с закупок

02 УСН — оптимальный выбор для большинства аптек

Упрощённая система налогообложения — наиболее распространённый режим среди малых и средних аптек. Выбор между двумя вариантами УСН зависит от структуры расходов: если затраты на закупку товара составляют более 60–70% от выручки, выгоднее применять «Доходы минус расходы».

При УСН «Доходы» (6%) налог рассчитывается со всей выручки без учёта расходов — удобно для аптек с высокой рентабельностью и небольшой долей закупочных затрат. При УСН «Доходы минус расходы» (15%) в расходы включаются стоимость закупленных медикаментов, аренда, зарплата сотрудников, коммунальные платежи.

Практический пример

Аптека с выручкой 5 млн ₽ в год и расходами 3,8 млн ₽: при УСН «Доходы» налог = 300 000 ₽; при УСН «Д−Р» налог = (5 000 000 − 3 800 000) × 15% = 180 000 ₽. Выгода очевидна при высокой доле расходов.

03 ПСН — для небольших аптек-ИП

Патентная система позволяет ИП заранее знать сумму налога: она фиксирована и не зависит от реального дохода. Это удобно для планирования бюджета. Стоимость патента рассчитывается исходя из потенциально возможного дохода, установленного региональным законодательством.

  • Не нужно сдавать налоговую декларацию
  • Минимальная отчётность — только книга учёта доходов
  • Нельзя применять, если годовой доход превысил 60 млн ₽
  • Доступна только для ИП, не для ООО

Практическое руководство

Как выбрать систему налогообложения для аптеки: пошаговый алгоритм

Владелец аптеки и налоговый консультант изучают схему выбора системы налогообложения

Шаг 1

Определите организационно-правовую форму

ИП имеют доступ ко всем режимам, включая ПСН. ООО могут выбирать только между ОСНО и УСН. Это первый фильтр при выборе.

Шаг 2

Оцените прогнозный годовой оборот

Если планируемая выручка превышает 265,8 млн ₽ — только ОСНО. До 60 млн ₽ для ИП — рассмотрите ПСН. Для промежуточных значений — УСН.

Шаг 3

Проанализируйте структуру расходов

Рассчитайте долю расходов в выручке. Свыше 60% — выгоднее УСН «Доходы минус расходы». Менее 60% — рассмотрите УСН «Доходы» или ПСН.

Шаг 4

Проверьте контрагентов

Если аптека планирует поставки в госучреждения или работу с плательщиками НДС — ОСНО предпочтительнее, так как позволяет выставлять счета-фактуры.

Шаг 5

Учтите региональные льготы

Субъекты РФ вправе снижать ставку УСН «Доходы» до 1%, а «Доходы минус расходы» — до 5%. Уточните условия в своём регионе.

Шаг 6

Рассчитайте итоговую налоговую нагрузку

Сравните суммы налогов по каждому режиму с учётом страховых взносов, которые при УСН «Доходы» уменьшают налог на 50% (для ООО) или до 100% (для ИП без сотрудников).

Часто задаваемые вопросы

FAQ: налогообложение аптеки

Может ли аптека применять УСН, если продаёт алкогольные настойки? +

Да, аптека может применять УСН даже при наличии спиртосодержащих лекарственных препаратов в ассортименте. Запрет на УСН для торговли подакцизными товарами касается, например, алкогольных напитков для употребления, но не лекарственных форм на спиртовой основе, реализуемых через аптечные учреждения.

Когда нужно подать заявление о переходе на УСН? +

При регистрации нового ИП или ООО — в течение 30 дней с момента постановки на учёт. При переходе с другого режима — до 31 декабря текущего года, чтобы применять УСН с 1 января следующего. Нарушение сроков приведёт к автоматическому применению ОСНО.

Как учитываются страховые взносы при налогообложении аптеки на УСН? +

При УСН «Доходы» страховые взносы уменьшают рассчитанный налог: ООО и ИП с сотрудниками — до 50% от суммы налога; ИП без наёмных работников — до 100%, то есть налог может быть снижен до нуля. При УСН «Доходы минус расходы» страховые взносы включаются в состав расходов и уменьшают налогооблагаемую базу.

Нужна ли онлайн-касса при всех режимах налогообложения? +

Да. Аптеки обязаны применять контрольно-кассовую технику (ККТ) при расчётах с физическими лицами независимо от применяемой системы налогообложения. Исключений для аптечного бизнеса по этому вопросу не предусмотрено.

Может ли аптека совмещать несколько систем налогообложения? +

ИП вправе совмещать УСН и ПСН, если разные виды деятельности разграничены. Например, аптека на ПСН и оптовая торговля медизделиями на УСН. Совмещение ОСНО и УСН — недопустимо. При совмещении необходимо вести раздельный учёт доходов и расходов.

Следующий шаг

Не уверены, какой режим подходит вашей аптеке?

Оптимальное налогообложение аптеки зависит от десятков факторов: оборота, ассортимента, формы собственности и региона. Изучите наши материалы по бухгалтерскому учёту в фармации или задайте вопрос специалисту — правильный выбор экономит от 100 000 ₽ в год.

Материал обновлён в 2024 году · Информация носит образовательный характер